Comarch prend ses racines dans le monde universitaire. L'entreprise a vu le jour au début de 1991 en tant que spin-off commerciale de l'Université de Technologie et de Science de Cracovie, sous le nom de Computer and Communication Consultants Ltd. Ses origines académiques ont influencé le développement de l'entreprise et ont déterminé une orientation technique. De nos jours, Comarch entretient toujours des liens étroits avec ce monde. Le changement de nom en Comarch a eu lieu en novembre 1994,